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25bp DNA ladder(25-500bp)

25bp DNA ladder(25-500bp)

產(chǎn)品編號:RTM444

產(chǎn)品規(guī)格:50次

數(shù)量
價格 ¥300

25bp DNA ladder

● 產(chǎn)品編號及規(guī)格:

RTM444          50次 (250 μl)    

● 產(chǎn)品組成:

貨號

名稱

規(guī)格

RTM444-01

25bp DNA ladder

50次(250 μl

DL070-01

6×Native-PAGE DNA上樣緩沖液

1 ml

DL020-01

6×DualColor DNA loading buffer (雙染料)

1 ml

● 產(chǎn)品簡介:

本產(chǎn)品是由8條帶狀雙鏈DNA條帶組成的精準定量Marker,適用于聚丙烯酰胺凝膠電泳中DNA條帶大小和含量的分析。8條帶的大小分別為25,50,100,150,200,300,400,500bp。其中200bp bp條帶為加亮帶,含量為100ng/5μl,其余條帶濃度為50ng/5μl。

本產(chǎn)品為雙鏈DNA Marker,適用于非變性的PAGE電泳和瓊脂糖凝膠電泳,不適用于尿素PAGE電泳。由于片段較小,如使用瓊脂糖分離,建議使用高分辨率瓊脂糖凝膠電泳分離。

按照每次上樣5 μl計算,該產(chǎn)品可以使用50次。

● 儲存、效期及運輸:

  -20 貯存;有效期3年;濕冰運輸。

● 使用方法:

一、 TBE-PAGE凝膠分離:

1.1制備凝膠步驟:

1.1.1參照凝膠模具說明書,裝配好凝膠模具。

1.1.2按照表一將不同體積的成分在小燒杯或試管中混合;最后加入10%APS和TEMED,輕輕攪拌使其混勻,避免產(chǎn)生氣泡。

     注:25bp DNA ladder適用于配制15%TBE-PAGE膠。

1.1.3在凝膠模具中灌入適量分離膠溶液(對于mini-gel,凝膠液加至約距前玻璃板頂端1.5 cm或距梳齒約0.5 cm即可),然后在分離膠溶液上輕輕覆蓋一層1-2 cm的無水乙醇,使凝膠表面保持平整。

1.1.4靜置10-20分鐘,待分離膠和乙醇層之間出現(xiàn)一個清晰的界面后,說明凝膠已聚合

表一 TBE-PAGE分離膠配方表 (總體積5 ml,適用于1mm厚度小板膠)

各組份體積(ml

最佳DNA分離范圍

凝膠濃度

滅菌水

30%PAA291

5×TBE

10%APS

TEMED

70-450 bp

6%

3

1.0

1.0

0.05

0.005

60-460 bp

8%

2.66

1.34

1.0

0.05

0.005

50-300 bp

10%

2.33

1.67

1.0

0.05

0.005

40-200 bp

12%

2

2.0

1.0

0.05

0.005

25-150 bp

15%

0.5

2.5

1.0

0.05

0.005

5-100 bp

20%

0.66

3.34

1.0

0.05

0.005

1.1.5去除覆蓋在分離膠上的乙醇;按照表二將不同體積成分在一個小燒杯或試管中混合;最后加入10%過硫酸銨和TEMED,輕輕攪拌使其混勻,避免產(chǎn)生氣泡。

表二 TBE-PAGE 4%濃縮配方表 (總體積1.5 ml,適用于1mm厚度小板膠)

各組份體積(ml

凝膠濃度

滅菌水

30%PAA291

5×TBE

10%APS

TEMED

4%

1.0

0.2

0.3

0.02

0.002

1.1.6將濃縮膠溶液加至分離膠的上面,直至凝膠溶液到達前玻璃板的頂端;將梳子插入凝膠內,避免產(chǎn)生氣泡。

1.1.7靜置30-60分鐘,等待濃縮膠聚合。

注:凝膠的聚合時間與環(huán)境溫度有關。夏天溫度較高時,聚合較快;冬天氣溫低時,聚合時間會延長??梢愿鶕?jù)環(huán)境溫度的不同調節(jié)APS的加入量。

1.2 電泳:

1.2.1 將凝膠板固定在電泳裝置上,往上槽和下槽中加入1×TBE電泳液,1 ml吸頭沖洗加樣孔1-2次。

1.2.2 取待測樣品,加入相應體積6×Native PAGE DNA上樣緩沖液,如5 μl樣品加1 μl 上樣緩沖液,短暫離心后取5-10 μl上樣。 25bp DNA ladder已經(jīng)含有上樣緩沖液,1 mm厚10齒梳子直接上樣5 μl,其余梳齒和厚度凝膠適量調整上樣量。

1.2.3 連接電源線,打開電源開關。200 V穩(wěn)壓電泳。至二甲苯菁指示前沿到達距離凝膠下沿二分之一位置時結束電泳(~50bp),此時溴酚藍指示前沿在凝膠下沿邊界(~17bp)。

PAGE凝膠濃度

恒電壓

起始電流

結束電流

二甲苯菁

溴酚藍

電泳時間

15%

200 V

25-30 mA/板膠

10-18 mA/板膠

~50 bp

~17 bp

35+min

1.3染色:

1.3.1 漂洗:玻璃板上拆下凝膠后,適量蒸餾水漂洗3-5分鐘。

1.3.2 染色液配制:

     TBE-PAGE膠可以使用RealSafe類染料后染染色,以下程序用RealSafe Red核酸染料(貨號:GR002)進行染色。即用型染色液配制:

 

即用型RealSafe核酸染色液

 

配制量100 ml

1×TBE

100 ml

RealSafe Red核酸染料

10 μl

1.3.3染色和觀察:

     凝膠浸泡于即用型染色液中,常溫避光搖床40-60 rpm染色30 分鐘。紫外光或藍光儀下觀察。


 二、 瓊脂糖凝膠分離:

2.1 瓊脂糖凝膠制備:

    由于片段較小,建議選用高分辨率瓊脂糖(貨號AR1036)制膠。以下步驟以制備50 ml 3%凝膠為例:

稱取1.5 g瓊脂糖于玻璃三角瓶中,加入50 ml 1×TAE,5 μl RealSafe Red核酸染料或其他核酸染料(如EB,GoldView),混勻,蓋好瓶蓋,微波爐中火加熱至沸騰,輕搖混勻,重復1-2次至瓊脂糖完全溶解,無可見顆粒。倒入制膠容器中,插好梳子,常溫凝固30-50分鐘至凝膠完全凝固。

2.2 電泳:

取待測樣品,加入相應體積6×DualColor DNA loading buffer,如10 μl樣品加2 μl 上樣緩沖液,短暫離心后取5-10 μl上樣。 25bp DNA ladder 1 mm厚10齒梳子上樣5 μl,其余梳齒和厚度凝膠適量調整上樣量。

建議電泳條件:凝膠濃度為3%,電泳電壓8-10 v/cm(單位電壓指電泳槽陰陽極之間的距離電壓,如陰極陽極之間的距離為20 cm,可以用160-200 V電壓進行穩(wěn)壓電泳),待溴酚藍指示前沿距離凝膠末端2 cm時終止電泳,電泳時間35-40分鐘。

瓊脂糖濃度

電泳緩沖液

二甲苯菁

溴酚藍

單位電壓

電泳時間

3%

1×TAE

~1000 bp

~100 bp

8-10 V/cm

40min+

1×TBE

~700 bp

~60 bp

8-10 V/cm

40min+

2.3觀察條帶。

注:使用EB或Goldview染料時,由于染料本身帶正電荷較多,隨著電泳時間的延長,染料會向陰極聚集,導致小片段核酸結合的染料含量降低,會出現(xiàn)小片段的DNA片段紫外燈下亮度變弱或不可見。此時可以將膠浸泡于含有染料的電泳緩沖液中染色15-20分鐘即可看到小片段。使用RealSafe類染料可以直接觀察條帶。

2.4 實驗示例:

 


 
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