動(dòng)物線粒體提取試劑盒(細(xì)胞樣品)
(Animal Cell Mitochondria Isolation
Kit)
產(chǎn)品貨號(hào)
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名稱
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規(guī)格
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RTD8115
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動(dòng)物細(xì)胞線粒體提取試劑盒(細(xì)胞樣品)
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50次
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● 產(chǎn)品簡(jiǎn)介
動(dòng)物細(xì)胞線粒體提取試劑盒(Animal
Cell Mitochondria Isolation Kit)可以快速便捷分離培養(yǎng)細(xì)胞的線粒體。試劑盒的緩沖系統(tǒng)不含任何表面活性劑和螯合劑EDTA,分離獲得的線粒體純度較高,并且絕大部分分離獲得的線粒體都含有完整的內(nèi)膜和外膜,可以用于線粒體的生理功能等方面的研究。另外,優(yōu)化的裂解配方配套離心柱法有效裂解細(xì)胞,省去了經(jīng)典方法使用玻璃勻漿器的繁瑣操作,更加省時(shí)省力。同時(shí),本試劑盒在分離線粒體的同時(shí)可以獲得去除線粒體的細(xì)胞胞漿蛋白,可以研究線粒體蛋白向胞漿內(nèi)的運(yùn)輸機(jī)制。
該產(chǎn)品約30分鐘即可完成培養(yǎng)細(xì)胞線粒體的提取。線粒體是在溫和、非變性條件下提取的,結(jié)合不同的溶解液,溶解后的線粒體可以用于SDS-PAGE變性電泳檢測(cè)、Blue
Native非變性電泳檢測(cè)以及等電聚焦電泳等。另外,提取的線粒體具有生理功能,可以用于線粒體的生理功能等方面的研究。
按照每次提取2×107細(xì)胞計(jì)算,試劑盒可以使用大約50次。
● 產(chǎn)品組成
產(chǎn)品編號(hào)
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名稱
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規(guī)格
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貯存
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RTD8115-01
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分離緩沖液A
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15 ml
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-20℃
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RTD8115-02
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分離緩沖液B
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15 ml
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-20℃
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RTD8115-03
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漂洗緩沖液
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30 ml
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-20℃
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RTD8115-04
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貯存緩沖液
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3 ml
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-20℃
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PS1020
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變性蛋白溶解液
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5 ml
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RT
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CD-50
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離心柱套裝
(包含離心柱和2ml連蓋收集管)
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50個(gè)
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RT
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說(shuō)明書
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● 貯存條件和運(yùn)輸:
按照標(biāo)簽溫度貯存;有效期一年;濕冰運(yùn)輸。
● 用前必讀:
1. 離心機(jī)請(qǐng)調(diào)整成RCF/g模式,按照離心力設(shè)置離心機(jī)(不要根據(jù)轉(zhuǎn)速rpm模式設(shè)置),所有離心步驟都需要在4℃低溫離心機(jī)中進(jìn)行。
2. 將分離緩沖液A,分離緩沖液B,漂洗緩沖液和貯存緩沖液混勻后放置于冰上。將離心柱套入2 ml連蓋收集管中,蓋好管蓋,放置于冰上預(yù)冷。
3. 蛋白提取推薦添加蛋白酶抑制劑(自備,試劑盒不提供),根據(jù)蛋白酶抑制劑母液濃度提前添加在膜蛋白提取溶液中(如抑制劑母液是 100×,添加時(shí)按照1:100添加,即1ml膜蛋白提取溶液添加10μl抑制劑)。研究蛋白磷酸化,需要添加磷酸酶抑制劑(自備,試劑盒不提供)。
4.
蛋白定量推薦使用BCA方法,可以選擇BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒(貨號(hào):RTP7102)。
● 使用方法:
一. 準(zhǔn)備溶液:
常溫溶解試劑盒中的各種溶液,溶解后立即置于冰上并混勻。如果最終實(shí)驗(yàn)?zāi)康氖侵苽渚€粒體蛋白樣品,根據(jù)樣品數(shù)量,取適量體積分離緩沖液A加入蛋白酶抑制劑。按照下表大體估算分離緩沖液A的使用體積:
細(xì)胞類型
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培養(yǎng)器皿
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細(xì)胞數(shù)量
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細(xì)胞沉淀體積(PCV)(μl)
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分離緩沖液A(μl)
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懸浮細(xì)胞
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~2×107
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~200
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250
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貼壁細(xì)胞
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96孔板
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~1×105
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調(diào)整細(xì)胞數(shù)目到2×107
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250
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24孔板
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~5×105
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6孔板
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~2.5×106
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25cm2培養(yǎng)瓶
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~2×106
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75cm2培養(yǎng)瓶
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~8×106
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35
mm培養(yǎng)皿
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~2×106
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60
mm培養(yǎng)皿
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~5×106
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100
mm培養(yǎng)皿
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~1.5×107
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注:(二百萬(wàn),2×106)HeLa細(xì)胞,其細(xì)胞沉淀體積(PCV,Packed Cell Volume)大約為20 μl。
二. 收集細(xì)胞:
2.1
對(duì)于貼壁細(xì)胞:細(xì)胞用PBS漂洗一遍,棄PBS;再加入適量PBS,用細(xì)胞刮刀刮下細(xì)胞,或用0.02%
EDTA(0.5
mM)溶液處理細(xì)胞使細(xì)胞不再貼壁很緊,并用移液器吹打下細(xì)胞。400
g(~2000
rpm)
4℃離心5
min收集細(xì)胞,盡最大努力吸盡上清,留下細(xì)胞沉淀備用。盡量避免用胰酶消化細(xì)胞,以免胰酶降解需提取的目的蛋白。
2.2
對(duì)于懸浮細(xì)胞:400
g(~2000
rpm)4℃離心5
min收集細(xì)胞,用PBS洗一遍,離心收集細(xì)胞,盡最大努力吸盡上清,留下細(xì)胞沉淀備用。
三. 裂解細(xì)胞膜:
3.1細(xì)胞沉淀中加入250
μl準(zhǔn)備好的分離緩沖液A(含蛋白酶抑制劑),用移液器吹打重懸細(xì)胞沉淀,渦旋劇烈震蕩30-60秒,冰浴處理10分鐘,間歇2-3混勻。
注:建議將起始細(xì)胞數(shù)不要低于2×107,否則將導(dǎo)致最后線粒體得率過(guò)低。
3.2
將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移到離心柱中,蓋上管蓋,16,000
g(~13000
rpm) 4℃離心1分鐘,離心后收集管底部會(huì)有沉淀形成。
注:離心柱最大體積為600 μl;確保離心機(jī)可以在10秒內(nèi)達(dá)到16000 g。
3.3 棄去離心柱,蓋好2
ml收集管管蓋,用1ml移液器輕柔吹打重懸收集管中的沉淀。
四. 去除細(xì)胞核和未破碎的細(xì)胞:
溶液700 g(~2700 rpm)
4℃離心1分鐘,用200
μl吸頭小心將上清(上清稍有渾濁)轉(zhuǎn)移到新的1.5
ml離心管中。注意:轉(zhuǎn)速不要超過(guò)700g,否則會(huì)降低線粒體的得率。
關(guān)鍵步驟:吸取上清時(shí)不要觸及沉淀,甚至可以丟棄部分上清不吸取,以免上清(含線粒體)中污染核蛋白。如果使用250 μl分離緩沖液A,建議吸取200 μl上清。此步驟得到的細(xì)胞核純度不高,混雜有沒(méi)有完全破碎的完整細(xì)胞,不建議用于相關(guān)實(shí)驗(yàn)。
五. 收集線粒體:
5.1
上清中加入等體積的分離緩沖液B(如步驟4吸取200
μl上清,則加入200
μl分離緩沖液B),混勻;
5.2
16000 g(~13000
rpm)
4℃離心10分鐘,用200
μl吸頭吸去上清,沉淀即為提取的線粒體。上清是胞漿蛋白,如需要可保存?zhèn)溆谩?
關(guān)鍵步驟:此步驟必須完全將上清吸取干凈,可以用200μl吸頭分次吸取上清,最后用10 μl吸頭將殘余上清徹底吸凈,以免線粒體中污染胞漿蛋白。
六. 線粒體漂洗:
線粒體沉淀中加入0.5 ml 漂洗緩沖液,輕柔重懸沉淀,16,000 g,4℃離心5分鐘,棄上清,沉淀即為漂洗后的線粒體。
七. 線粒體的使用:
7.1 線粒體功能研究:
如果用于完整線粒體的功能或酶活性研究,初始2×107細(xì)胞分離得到的線粒體樣品中加入100-150
μl線粒體貯存緩沖液,重懸線粒體后-80℃?zhèn)溆?。不建議長(zhǎng)期貯存,盡快使用。
7.2 線粒體蛋白電泳:
7.2.1線粒體蛋白變性樣品處理:
7.2.1.1 初始2×107細(xì)胞分離得到的線粒體沉淀中建議使用50
μl變性蛋白溶解液(貨號(hào):PS1020)溶解線粒體沉淀;
7.2.1.2
BCA方法測(cè)定蛋白濃度(貨號(hào):RTP7102);
7.2.1.3用變性蛋白溶解液調(diào)整蛋白濃度為1
μg/μl,按需分裝,每管50
μl,-80℃保存待用;
7.2.1.4取一管50
μl樣品加入SDS-PAGE上樣緩沖液(貨號(hào):PL080,PL113,PL121)處理,建議調(diào)整上樣液濃度為0.5
μg/μl;對(duì)于多次跨膜蛋白(Multi-pass
membrane protein)的變性電泳檢測(cè),樣品建議使用37℃處理30分鐘,不要95℃加熱5分鐘,因?yàn)樵?5℃高溫情況下,多次跨膜蛋白極易聚集形成多聚體,樣品會(huì)聚集,WB檢測(cè)會(huì)表現(xiàn)為比實(shí)際蛋白大小更大的分子量;
7.2.1.5
使用SDS-PAGE凝膠(貨號(hào):RTD6132,RTD6116)電泳,每個(gè)泳道上樣10-40
μl(5-20
μg)。
7.2.2 線粒體蛋白BN非變性樣品處理:
7.2.2.1 初始2×107細(xì)胞分離得到的線粒體沉淀中建議使用50
μl膜蛋白重懸液(BN電泳用)(貨號(hào):PN1020)重懸線粒體沉淀;
7.2.2.2
BCA方法測(cè)定蛋白濃度(貨號(hào):RTP7102);
7.2.2.3 用膜蛋白重懸液(BN電泳用)(貨號(hào):PN1020)調(diào)整蛋白濃度為1
μg/μl,按需分裝,每管50
μl,-80℃保存待用;
7.2.2.4
取一管50
μl樣品,溶化混勻后4℃
16000 g 5分鐘,去除上清,保留沉淀;
7.2.2.5 沉淀中加入50
μl膜蛋白增溶液A(貨號(hào):DM1080),輕柔重懸沉淀,盡量不產(chǎn)生氣泡,冰浴10分鐘;
7.2.2.6 4℃
16000 g 15分鐘,取上清至一干凈1.5 ml離心管中即為增溶后線粒體蛋白溶液(小心不要吸取沉淀),此時(shí)得到的線粒體蛋白濃度為1
μg/μl,其中去垢劑DDM(n-Dodecyl
β-D-maltoside,β-DM, n-十二烷基-β-D-麥芽糖苷)終濃度為1%;
7.2.2.7 線粒體蛋白溶液中加入1/10體積10×膜蛋白A型上樣緩沖液(配套膜蛋白增溶液A使用)(貨號(hào):PL130),使用BN凝膠電泳(貨號(hào):RTD6139,RTD6140),每個(gè)泳道上樣5-20
μg。
7.2.3 線粒體蛋白等電聚焦樣品處理(2D凝膠第一維電泳):
建議線粒體沉淀中使用溶解液:7
M尿素,2
M硫脲,
2%CHAPS,20 mM DTT(自備,試劑盒不提供)。
八 線粒體產(chǎn)量和質(zhì)量的評(píng)價(jià):
8.1 線粒體產(chǎn)量:
細(xì)胞系
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細(xì)胞數(shù)量
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線粒體蛋白
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K562
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2×107
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100-150 μg
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Jurkat
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2×107
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80-100 μg
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Hela
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2×107
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100-150 μg
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NIH-3T3
|
2×107
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80-120 μg
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8.2 線粒體質(zhì)量評(píng)價(jià):
線粒體質(zhì)量評(píng)價(jià)首先看提取的線粒體是否具有完整的內(nèi)外膜結(jié)構(gòu)(進(jìn)行線粒體功能活性研究),其次要看裂解后的線粒體蛋白是否有明顯的富集,其三要看裂解后的線粒體蛋白是否有其他組分交叉污染,最后看提取的線粒體中是否可以檢測(cè)出目的蛋白。使用專門的線粒體內(nèi)參檢測(cè)(下表),可以初步確認(rèn)提出的是線粒體蛋白。線粒體蛋白是否有效富集需要用總蛋白作為對(duì)照,與總蛋白相比,線粒體內(nèi)參蛋白是否有明顯富集。線粒體蛋白中的交叉污染可以用其他組分內(nèi)參檢測(cè)線粒體蛋白樣品,如關(guān)注線粒體蛋白中是否有胞漿蛋白污染,可以使用胞漿蛋白內(nèi)參檢測(cè)線粒體蛋白,檢測(cè)條帶的強(qiáng)弱即說(shuō)明線粒體蛋白與胞漿蛋白交叉污染的程度。用目標(biāo)蛋白抗體檢測(cè)線粒體蛋白,驗(yàn)證是否可以檢測(cè)到目的蛋白,蛋白大小是否符合預(yù)期。
位置
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內(nèi)參名稱
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大小 kD
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細(xì)胞膜
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Na-K ATPase
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100
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內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜
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Calnexin
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~90
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線粒體膜
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COX IV
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17
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許多研究人員利用
WB對(duì)分離的線粒體蛋白進(jìn)行純度檢測(cè),經(jīng)常發(fā)現(xiàn)一些常用的胞漿內(nèi)參能在線粒體蛋白中檢測(cè)到,例如β-actin[1],
GAPDH [2] 和 β-tubulin,這是由于這些胞漿內(nèi)參不僅存在于胞漿也存在于線粒體中,因此可以在線粒體蛋白中檢測(cè)到胞漿內(nèi)參。更多信息,請(qǐng)參閱以下論文:
1
Hatch, Anna L., Pinar S. Gurel, and Henry N. Higgs. Novel roles for actin in
mitochondrial fission. Journal of Cell Science (2014) 127,
1–12
2
Zhang, Jin-Ying, et al. Critical
protein GAPDH and its regulatory mechanisms in cancer cells. Cancer
Biol Med 2015;12:10-22.
九 實(shí)驗(yàn)示例:
不同去垢劑處理K562細(xì)胞線粒體3-12%BN電泳